Retour sur la journée « Protéines en Santé »

Carole Guillonneau est co-responsable de la thématique « T cell development and immuno tolerance » dans l’unité de recherche UMR1064-CR2TI à Nantes. Elle a présenté les travaux menés par Romain Humeau dans son équipe, et qui portent sur l’IL-34 et son rôle dans la tolérance immunitaire via les lymphocytes T régulateurs. Des agonistes de l’IL-34 pourraient ainsi présenter un intérêt dans le cadre de la transplantation d’organes ou le traitement des maladies auto-immunes. Les travaux, menés en collaboration avec les plateformes P2R et Impact, ont consisté en une prédiction in silico des résidus d’acides aminés importants pour l’interaction de l’IL-34 avec son récepteur, puis en la production d’IL-34 recombinante endotoxin-free, avec un optimisation à la fois de la qualité et des quantités produites.

Nicolas Boisgerault est Chargé de Recherche dans l’équipe 1 « ITMI » du CRCI2NA, dans laquelle il mène des travaux sur de nouveaux outils de lutte contre le cancer : les virus oncolytiques. Outre leur capacité de lyse cellulaire et de modulation de l’activité des cellules immunitaires, ces virus peuvent être utilisés comme vecteurs de molécules thérapeutiques. C’est l’objet des travaux de Nicolas, qui développe de nouveaux virus oncolytiques. Il explore également les mécanismes par lesquels ces virus utilisent et détournent les vésicules extracellulaires pour transférer du matériel. Nicolas a collaboré avec la plateforme Protim pour analyser le contenu des vésicules extracellulaires par spectrométrie de masse. Il développe aussi des modèles cellulaires de complexité croissante, tels que des sphéroïdes tumoraux pour l’étude des virus oncolytiques.

Claire Delehouzé et Stéphane Bach, de l’unité de recherche LBI2M, sont ensuite intervenus par visio-conférence pour présenter leurs travaux sur l’enzyme quinone reductase NQO2. A l’origine de cette étude, un screening d’inhibiteurs de la nécroptose, un mécanisme de mort cellulaire impliquée dans de nombreuses maladies humaines et régulée par des protéines kinases. Ce criblage a permis d’identifier des molécules contenant un noyau 7-aza-indole, dont les cibles cellulaires incluent la quinone reductase NQO2. Les travaux réalisés par Claire et Stéphane ont visé à caractériser l’interaction entre la NQO2 et le ligand identifié par le crible, par différentes méthodes : Cellular Thermal Shift Assay, essai enzymatique, et cristallographie, qui a impliqué la plateforme CristalO.

Hélène Munier-Lehmann est Chargée de Recherche dans l’équipe SysTox de l’unité de recherche « Health and Functional exposomics – HealthFex » à Paris. Lors de sa présentation, elle a abordé 2 projets :

• Nouvelles approches d’inhibition de l’intégration des rétrovirus, pour lequel elle a collaboré avec la plateforme Imp@ct et fait appel à la chimiothèque nationale.
• Identification de composés anti-SARS Cov-2, en ciblant la protéine NSP3 et la protéine d’enveloppe E, également avec l’utilisation de composés de la chimiothèque nationale.

Lucas Treps, Chargé de Recherche dans l’équipe 1 ITMI du CRCI2NA, a clôturé cette journée scientifique par l’exposé de ses travaux de recherche portant sur les interactions des cellules endothéliales avec le microenvironnement tumoral. Les cellules endothéliales subissent une transition de type EndoMT quand elles sont exposées à du milieu de culture de cellules tumorales (milieu conditionné) : elles perdent leur phénotype de cellules endothéliales pour acquérir un phénotype mésenchymateux. Dans l’étude présentée, une analyse protéomique du milieu conditionné de cellules tumorales a été réalisée pour identifier les protéines impliquées dans la transition EndoMT. Un profil des kinases dans des conditions de co-culture entre cellules endothéliales et cellules tumorales a également été effectué. Enfin, des modèles cellulaires plus complexes de type MultiCellular Tumor Spheroid (MCTS) ont été utilisés, en y incluant des cellules HUVEC, pour analyser le compartiment endothélial de l’environnement tumoral.