Cette journée sera l’occasion d’aborder les recherches réalisées dans le Grand Ouest sur le microbiote, à différents âges de la vie. Les intervenants présenteront leurs travaux dans les domaines de la nutrition, des maladies respiratoires, intestinales et neurodégénératives au travers des approches génomiques et bioinformatiques.
9:00 Accueil
Modérateurs : Michel NEUNLIST (UMR1235 TENS, Nantes) et Philippe Vandenkoornhuyse (UMR6553 ECOBIO, Rennes)
9:30 | Présentation de l’Axe Génomique de Biogenouest et des plateformes génomiques (GenoA, EcogenO, Genomer)
10:00 | Introduction générale « Microbiote et santé : état des connaissances », Hervé BLOTTIERE, UMR1280 PhAN, Nantes et MetaGenoPolis
10:30 | « Microbiote et Périnatalité – Overview des travaux de l’UMR PhAN », Hervé BLOTTIERE, UMR1280 PhAN, Nantes et MetaGenoPolis
10:45 | « Microbiote et Santé – Overview des travaux de l’UMR TENS », Michel NEUNLIST, UMR1235 TENS, Nantes
11:00 | Pause café
11:20 | « Shallow Shotgun : méthodes et outils pour l’analyse bio-informatique », Quentin LE BASTARD, UR1155 IICiMed, Nantes
11:50 | « Impact de l’antibiothérapie sur le microbiome et le résistome pulmonaire : exemple de la mucoviscidose », Geneviève HERY-ARNAUD, UMR1078 GGB, Brest
12:30 | Déjeuner
14:00 | « Exploration du lien entre niveau d’activité physique, profil métabolique à l’exercice et composition du microbiote intestinal. Premiers résultats de l’étude clinique pilote EXOMIC », Fréderic DERBRÉ, EA7470 M2S, Rennes
14:30 | « MiEHPAD : Faisabilité de l’analyse du microbiote en EHPAD », Guillaume CHAPELET, UMR1235 TENS, Nantes
15:00 | « Identification de souches bactériennes par séquençage Nanopore », Emeline ROUX, UMR1241 NuMeCan, Rennes
15:30 | « Premiers résultats du projet PROLIFIC : PROduits Laitiers et Ingrédients Fermentés Innovants pour des populations Cibles », Yves LE LOIR, UMR1253 STLO, Rennes
16:00 | « Étude de l’interaction entre le microbiote intestinal et son hôte humain via la modélisation métabolique in silico : établissement d’un score d’interaction », Anna LAMBERT, LS2N, Nantes
16:30 | Clôture