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SUMMARY:14èmes journées du Cancéropôle Grand-Ouest
DESCRIPTION:Ouvertes à tous les chercheurs\, cliniciens\, professionnels de santé et industriels du CGO\, des autres Cancéropôles de France et des organismes partenaires\, elles permettront de dresser un panorama des faits scientifiques qui ont marqué l’année 2019-2020. \nCe sera également l’occasion pour les équipes des différents axes d’appréhender de nouvelles problématiques et de faire émerger ainsi de nouvelles collaborations inter-réseaux et inter-régions. \nA l’occasion des 14èmes journées du Cancéropôle Grand Ouest\, une session posters permanente ainsi que des communications orales permettront aux jeunes chercheurs (chercheurs non statutaires : doctorants\, post-doctorants et internes de moins de 35 ans) du Grand Ouest de présenter leurs activités et projets dédiés pour tout ou partie à la recherche expérimentale ou clinique en cancérologie.
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LOCATION:Angers\, 49000\, France
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SUMMARY:Journée Analyse Structurale et Métabolomique
DESCRIPTION:Les plates-formes BIBS\, Corsaire et Phenotic sont heureuses de vous confirmer que leur journée d’animation scientifique annuelle aura bien lieu en visio-conférence le 6 octobre prochain. \nPlusieurs présentations seront organisées autour des thèmes suivants (programme complet) : \n\n9h30 – 12h30 : Stratégies analytiques visant la mise en évidence et la caractérisation de biomarqueurs d’effet consécutifs à l’exposition d’organismes vivants à des contaminants chimiques ou biologiques.\n14h00 – 17h00 : Quelles avancées technologiques et méthodologiques sur nos plates-formes d’Analyse Structurale et Métabolomique ?\n\nN’hésitez pas à vous inscrire.\nPour plus d’informations\, contactez marine.letertre@biogenouest.org 07 68 00 98 71. \nProgramme \n[9:30] Connexion à GoToMeeting\n[9:50] Introduction par Marine Letertre \nSession 1. Stratégies analytiques visant la mise en évidence et la caractérisation de biomarqueurs d’effet consécutifs à l’exposition d’organismes vivants à des contaminants chimiques et biologiques\n[10:00] Promesses et défis des approches non ciblées pour la mise en évidence de contaminants émergents et la caractérisation de l’Exposome chimique de l’Homme par Jean-Philippe ANTIGNAC\, plate-forme Corsaire-LABERCA\, Nantes.\n[10:20] De la métabolomique vers l’exposomique : challenges et perspectives par Arthur DAVID\, EHESP\, Rennes.\n[10:40] Etude de l’effet des ondes millimétriques à 60 GHz sur le vivant par approche métabolomique par David RONDEAU\, plate-forme Corsaire-BioEM\, Rennes.\n[11:00] Table ronde\n[11:20] Pause café\n[11:35] MytilOMICS – étude de la mortalité de la Moule\, Mytilus edulis\, par métabolomique non-ciblée par Samuel BERTRAND\, plate-forme Corsaire-ThalassOMICS\, Nantes.\n[11:55] Signalisation chimique et défenses de macroalgues brunes : exploration de la voie des oxylipines par Catherine LEBLANC\, plate-forme Corsaire-MetaboMer\, Roscoff.\n[12:15] Mise en place et caractérisation d’un modèle 3D de culture approprié pour servir de système de test par Georges ALZEB\, plate-forme Corsaire-Inserm\, Brest.\n[12:35] Pause repas \nSession 2. Quelles avancées technologiques et méthodologiques sur nos plateformes d’Analyse Structurale et Métabolomique ?\n[14:00] La mobilité ionique cyclique haute résolution et la fragmentation haute énergie : deux avancées puissantes en spectrométrie de masse pour les glycosciences par Mathieu FANUEL\, plate-forme BIBS\, Nantes.\n[14:20] Phenobean : un robot pour du phénotypage haut-débit de petites et moyennes plantes en milieu contrôlé par Tristan BOUREAU\, plate-forme Phenotic\, Angers.\n[14:40] Hyperpolarized NMR metabolomics at natural 13C abundance par Arnab DEY\, plate-forme Corsaire-CEISAM\, Nantes.\n[15:00] Pause café\n[15:15] Oligator: une interface graphique pour générer le spectre MS/MS théorique d’une structure d’oligosaccharide par Virginie LOLLIER\, plate-forme BIBS\, Nantes.\n[15:35] RMN multi-impulsionnelle appliquée à l’étude des interactions champignons/éponge et comparée aux méthodes conventionnelles par Aurore MICHAUD\, plate-forme Corsaire-ThalassOMICS-CEISAM\, Nantes.\n[15:55] Fusion d’images IRM et MALDI : une nouvelle approche pour l’étude du développement du grain de blé par Florent GRELARD\, plate-forme BIBS\, Nantes.\n[16:15] Quelques exemples d’application de sources à ionisation ambiante (DART et DESI) et de la source froide (Coldspray ionization) en analyse structurale et métabolomique par David Rondeau\, plate-forme Corsaire-BioEM\, Rennes.\n[16:35] Conclusion \n 
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SUMMARY:Journée "Microbiomes"
DESCRIPTION:Cette journée d’animation scientifique a été organisée sur le thème ‘microbiomes’ (programme). \nDes aspects variés concernant la place des microbiotes seront abordés au cours de cette journée\, notamment sur la santé humaine\, pour le développement et la résistance des plantes\, des algues. La compréhension de ce microbiote sera aussi largement abordée sous l’angle bio-informatique. \n\nProgramme : \n[9:30] « Le microbiote joue-t-il un rôle dans le comportement alimentaire ? » par Gaëlle BOUDRY\, UMR1241 NuMeCan\, Rennes \n[10:00] « Complexité de l’étude du microbiote intestinal chez le sujet âgé\, de la théorie à la pratique » par Guillaume CHAPELET\, CHU de Nantes \n[10:30] « Expanding our understanding of the algal holobiont: potential keystone bacterial species of Ectocarpus singled out through metabolic complementarity » par Elham KARIMI\, UMR8227 LBI2M\, Roscoff \n[11:00] « Microbiote et métagénomique\, de la recherche vers le soin » par Geneviève HERY-ARNAUD\, UMR1078 GGFB\, Brest \n[11:30] « Identification and quantification of strains in a strain mixture using variation graphs » par Kevin DA SILVA\, UMR6074 IRISA\, Rennes \n[12:00] « Le microbiote des plantes\, un enjeu scientifique » par Christophe MOUGEL\, UMR1349 IGEPP\, Le Rheu \n12:30 Buffet déjeunatoire \n[13:30] Présentation de l’Axe Génomique de Biogenouest \n[14:00] « Inferring biogeochemical landscapes from metagenomes » par Damien EVEILLARD\, UMR6004 LS2N\, Nantes \n[14:30] « Temporal dynamics of marine microbial communities: how far we can go with meta-barcoding data? » par Mariarita CARACCIOLO\, UMR7144 AD2M\, Roscoff \n[15:00] « A guided tour to computational microbiome analysis » par Erwan DELAGE\, UMR6004 LS2N\, Nantes \n[15:30] « Using metabolic complementarity in microbiome to understand interactions among organisms » par Arnaud BELCOUR\, UMR6074 IRISA\, Rennes
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SUMMARY:EPIMAR
DESCRIPTION:La première édition d’EPIMAR (EPIgenetics in MARine biology congress) se tiendra à Montpellier du 13 au 14 mai 2020. L’événement est organisé conjointement par le CNRS\, l’Ifremer et les Universités de Montpellier\, Perpignan et Caen Normandie. \nLa soumission des abstracts est possible jusqu’au 1er février 2020 et la date limite pour les inscriptions est fixée au 1er avril. \nAFFICHE
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SUMMARY:NAT & IGO joint meeting > 2021
DESCRIPTION:Reporté au printemps 2021.
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SUMMARY:VI. Core Management Workshop on Innovation in Core Facilities
DESCRIPTION:Life science research organizations all over the world have just gone through a phase of establishing and expanding core facilities. These are now generally acknowledged as key elements of scientific research of a state-of-the-art institute. However\, in the fast evolving environment of science and technology\, a new challenge has emerged: how can facilities maintain their competitive advantage and prepare themselves for the future to come. How to adapt? How to be future-proof? \nHow do core facilities keep up with innovations? What does innovation entail in a core facility setting and how to be part of an innovation ecosystem? \nWith this workshop we aim to work with a group of about 25 people on the topic of innovation in core facilities. We want to discuss its importance as part of the core facility’s mission and what it would entail to create value at the technological\, scientific\, and organisational level. Different aspects will be covered\, going from examples of innovation\, to creating the right mindset in the life science institutes. We will discuss the skills that are required\, the mandates that should be in place\, what expectations to manage\, and other requirements that are essential for innovative core facilities.
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SUMMARY:Journée Scientifique : Interactomique et complexes protéiques
DESCRIPTION:Programme :\n\nLes plates-formes de l’axe Protéomique (équipe\, équipements\, technologies et activités) :\n– Thomas RORET – CristalO\, Roscoff\n– Pierre WEIGEL – IMPACT\, Nantes\n– Frédéric PECORARI – P2R\, Nantes\n– Emmanuelle COM – Protim\, Rennes\nConférence « Carbohydrate-protein interactions in the perspective of biomedical applications » par Gerlind SULZENBACHER\, UMR 7257 Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB)\, Marseille\n« Innovations pharmacologiques pour l’étude des neurorécepteurs : intérêt du BRET et de la technologie AlphaScreen » par Séverine MORISSET-LOPEZ\, UPR 4301 Centre de Biophysique Moléculaire\, Orléans\n« Production d’anticorps monoclonaux à visée expérimentale et thérapeutique » par François DAVODEAU\, UMR 1232 Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes Angers (CRCINA)\, Nantes\n« La structure 3D de la nigritoxine – une protéine d’un nouveau repliement\, et qu’est-ce que cela nous apprend sur ses interactions ? » par Mirjam CZJZEK\, UMR 8227 Laboratoire de Biologie Intégrative des Modèles Marins (LBI2M)\, Roscoff\n« How the central domain of dystrophin acts to bridge F-actin to sarcolemmal lipids » par Olivier DELALANDE et/ou Jean-François HUBERT\, UMR 6290 Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR)\, Rennes\nTable ronde « Interactomique et complexes protéiques »\, animée par Charles PINEAU\, Protim\, Rennes\n\nPROGRAMME COMPLET\n6 FÉVRIER 2020 | Salle de conférence Station Biologique de Roscoff – Place George Teissier – 29688 Roscoff
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LOCATION:Roscoff\, Roscoff\, 29680\, France
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SUMMARY:Journée Epigénétique
DESCRIPTION:Pôle Numérique Rennes Beaulieu (PNRB) – Campus de Beaulieu – 263 Avenue Général Leclerc – 35042 Rennes \nProgramme \nVOIR LES PRÉSENTATIONS \n\nPrésentation de l’axe Génomique de Biogenouest\n« Régulations épigénétiques et interactions plantes-pathogènes : méthodes et applications » par Gaël LE TRIONNAIRE\, Inra IGEPP\, Le Rheu\n« Etude de la résistance à la chimiothérapie par criblage CRISPR/Cas9 » par Aurélien SERANDOUR\, UMR 1232 CRCINA\, Nantes\n« Epigenetic regulation and life cycle alternation in the brown alga Ectocarpus » par Marc COCK\, UMR 8227 LBI2M\, Roscoff\n« Dérèglement épigénétique dans l’autoimmunité\, quelles conséquences ? » par Anne BORDRON et Christelle LE DANTEC\, UMR 1227 LBAI\, Brest\n« Approche « long-read sequencing » par la technologie PacBio : exemple des gènes de groupes sanguins » par Yann FICHOU\, UMR 1078 GGFB\, Brest\n« Utilisation de l’épigénétique comme outil d’amélioration des plantes à multiplication végétative » par Jean-Marc CELTON\, Inra IRHS\, Angers\n« Etude du rôle mécanistique de facteurs de transcription dans les cardiomyocytes humains : retour d’expérience sur la technologie ChIP-Seq » par Robin CANAC\, UMR 1087 l’Institut du Thorax\, Nantes\n« Evolution\, Expression et Contrôle du compartiment répété chez les Spartines (polyploïdes) » par Armel SALMON\, UMR 6553 ECOBIO\, Rennes\n« Annotation fonctionnelle des génomes de poissons pour l’aquaculture en Europe » par Audrey LAURENT\, Inra LPGP\, Rennes
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SUMMARY:Journée Scientifique : Plan de Gestion des Données (DMP) et leur réutilisation
DESCRIPTION:La gestion des données numériques de recherche est nécessaire pour assurer la pérennité\, l’accessibilité et la réutilisation des données pendant et après un projet de recherche. Dans la logique de la science ouverte (Open Science) et du libre accès aux données de recherche (Open Research Data)\, les organismes de financement et les institutions exigent de plus en plus souvent l’élaboration d’un plan de gestion des données. Il importe d’anticiper les méthodes d’extraction ou d’analyse qui seront appliquées à ces données.\n\n \nProgramme :\n\n 	Introduction par les responsables de plates-formes de l’axe Bio-informatique de Biogenouest :\n– Audrey Bihouée – BiRD\, Nantes\n– Olivier Collin – GenOuest\, Rennes\n– Gildas Le Corguillé – ABiMS\, Roscoff\n 	« Rédiger un PGD :  quels enjeux pour l’ouverture et l’accessibilité des données de recherche et de la science ? » Marie-Laure Malingre\, Unité Régionale de Formation à l’Information Scientifique et Technique (URFIS)\, Rennes\n 	« DMP OPIDoR : un outil d’aide à la rédaction des plans de gestion de données » par Christine Jacquemot\, Institut de l’Information Scientifique et Technique (INIST)\, Nancy\n 	« Projet OpenLink : Une passerelle entre les outils de gestion de données d’imagerie pour appliquer les principes FAIR » par Julien Seiler\, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC)\, Strasbourg\n 	« Le projet maDMP4LS pour mettre le plan de gestion des données automatisé dans les mains des biologistes ! » par Olivier Collin\, GenOuest et IRISA\, Rennes\n 	« PRojet COPiLOtE  « Certification des Centres de Données et de Services du Pôle de Données Océan » » Mark Hoebeke\, Station Biologique de Roscoff\n 	« La gestion des données scientifiques au sein d’un Institut de recherche : l’exemple de l’Inra » par Esther Dzalé Yeumo Kaboré\, Inra\, Versailles\n 	« Re-use in data-driven sciences » par Alban Gaignard\, BiRD et Institut du thorax\, Nantes\n\nPROGRAMME COMPLET\n \n\n17 DECEMBRE 2019 | Amphithéâtre Inria Campus de Beaulieu – 263 Avenue Général Leclerc – 35042 Rennes
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SUMMARY:Forum annuel du projet d'Investissements d'Avenir IDEALG
DESCRIPTION:Le projet de recherche IDEALG\, porté par l’Université de Bretagne Loire et coordonné par la Station Biologique de Roscoff\, associe des organismes de recherche publics\, un centre technique des algues et cinq entreprises bretonnes spécialisées dans l’aquaculture et la valorisation des algues. \nForum annuel IDEALG\, le mercredi 27 novembre 2019 à l’Espace Mathurin Méheut de Roscoff  (salle Rannic\, près de la gare SNCF) où se dérouleront les présentations scientifiques en matinée. L’après-midi sera consacré aux échanges avec le public.
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SUMMARY:Journée Scientifique "du phénome au métabolome"
DESCRIPTION:A partir de 9h : Amphithéâtre L003– Bâtiment L – UFR Sciences | 2 boulevard Lavoisier – 49000 ANGERS\n\nPour vous inscrire (obligatoire) merci de cliquer ICI.\n\nPROGRAMME\n\n\n\n9:00\nCafé d’accueil\n\n\n9:30\nIntroduction par Hélène Rogniaux et Alain Bouchereau\, coordinateurs de l’axe Analyse Structurale et Métabolomique de Biogenouest.\n\n\n9:50\n« Bio-sourced starch-based nanocomposites for the elaboration of biomaterials » par Veronica Nessi\, UR1268 BIA\, Nantes.\n\n\n10:10\n« Modélisation statistique de la croissance du grain de blé à partir de plusieurs modalités d’imagerie » par Thang-Duong-Quoc Le\, plate-forme BIBS\, Nantes.\n\n\n10:30\n« Évaluation du kit MxP500 de Biocrates en complément des analyses non-ciblées » par Yann Guitton\, plate-forme Corsaire-Laberca\, Nantes.\n\n\n10:50\nPause\n\n\n11:20\n« Assistance aux analyses déréplicatives par RMN-13C » par Séverine Derbré\, EA921 SONAS\, Angers.\n\n\n11:40\n« In vitro testing of metabolic complementarity as a predictor of mutualistic interactions » par Bertille Burgunter-Delamare\, UMR8227 LBI2M\, Roscoff.\n\n\n12:00\n« Signatures métaboliques de la réponse au Phoma chez le colza par imagerie MS » par Anani Amegan Missinou\, UMR1342 IGEPP\, Le Rheu.\n\n\n12:30\nDéjeuner\n\n\n14:00\n« Authentification des produits laitiers par RMN lipidomique » par Lenny Haddad\, UMR6230 CEISAM\, Nantes.\n\n\n14:20\n« Instrinsically Quantitative 2D NMR for Targeted Metabolomics » par Jonathan Farjon\, plate-forme Corsaire et UMR6230 CEISAM\, Nantes.\n\n\n14:40\n« OMICS integration for antimicrobial natural product isolation from Serratia proteamaculans co-cultures » par Simon Begrem\, EA2160 MMS\, Nantes.\n\n\n15:00\n« Recalage temporel et multimodal pour la caractérisation d’interactions plantes – pathogènes » par Melen Leclerc\, UMR1342 IGEPP\, Le Rheu.\n\n\n15:20\n« Impacts du stress hydrique sur la production de graines de colza (rendements\, compositions\, germinations et longévités) » par Grégoire Bianchetti\, UMR1342 IGEPP\, Le Rheu.\n\n\n15:40\nDiscussion et conclusion
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