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SUMMARY:Congrès Incit 22′
DESCRIPTION:Immunology and New Concepts in Immunotherapy\n\n\n\nCe premier congrès d’INCIT vise à faire le point sur les derniers développements en terme de stratégies d’immunothérapie dans le cancer\, l’inflammation et les maladies infectieuses\, par des équipes leaders dans ce domaine et par les équipes d’INCIT.
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SUMMARY:3rd International Plant Spectroscopy Conference
DESCRIPTION:Welcome to the 3rd International Plant Spectroscopy Conference!\nThe 3rd International Plant Spectroscopy Conference (IPSC2022) will be held in Nantes\, France\, in September – from Monday 12th to Thursday 15th.\nThis event is part of the biennial conference series\, organized jointly with the International Society for Plant Spectroscopy (ISPS) and the French National Research Institute for Agriculture\, Food and Environment (INRAE).\nWe encourage everyone to share their research concerning the potential and use of different spectroscopic techniques in various fields of plant sciences by submitting an abstract for oral or poster presentation.\nThe topics include (but are not limited to): \n\nFTIR (micro)spectroscopy\nRaman (micro)spectroscopy\nAutofluorescence spectroscopy and imaging\nMass spectrometry and imaging\nNMR spectroscopy and imaging\nRelated chemometric approaches\n\nIn addition to scientific sessions\, we invite both beginners and experienced researchers to participate in four technical workshops:\n\nData analysis techniques\nSample preparation\nSpectral technique selection\nCorrelative and multimodal imaging\n\nThe goal is to encourage discussion\, share experiences\, and questions about your practice\, and improve your technical skills and knowledge. \nSee the pre-programme \nA special issue of Biomolecules will cover the conference\, with discounts for conference participants and an award for the best poster.\nWe are confident that IPSC2022 will be an unforgettable event and we cordially invite you to join us in Nantes\, France\, in September 2022!
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SUMMARY:Congrès Analytics 2022
DESCRIPTION:Les plateformes BIBS et CORSAIRE vous invitent à participer nombreux au congrès Analytics\, qui se tiendra du 5 au 8 septembre à la Cité des Congrès de Nantes. \nEvènement inédit dans ce périmètre en sciences analytiques\, Analytics abordera de nombreuses thématiques d’intérêt dans Biogenouest : sciences Omiques (protéomique\, métabolomique\, peptidomique…)\, analyses de traces\, bioinformatique et biostatistiques pour les Omiques\, imageries in vivo et in vitro\, etc. \nLes domaines d’application sont extrêmement variés et couvrent la santé humaine et animale\, les sciences des plantes\, l’environnement\, l’alimentation\, les sciences des matériaux\, la toxicologie\, les sciences du patrimoine. \nLes inscriptions sont ouvertes et il reste 1 mois pour soumettre un résumé : \nInscriptions \nSoumission de résumés \nQuelques dates clés : \n–       Clôture des soumissions : 3 juin \n–       Clôture des inscriptions au tarif « early-bird » : 4 juillet \nDes ateliers de formation sont proposés le lundi matin. \nN’hésitez pas à suivre toutes les actualités sur le site web (www.analytics2022.fr) ou sur Twitter (https://twitter.com/2022Analytics) \nCAP A L’OUEST ! \nLe comité d’organisation d’Analytics 2022.
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SUMMARY:JOBIM
DESCRIPTION:Les Journées Ouvertes en Biologie\, Informatique et Mathématiques (JOBIM) sont l’occasion de découvrir les avancées scientifiques et techniques de la bioinformatique. Cette session 2022 abordera de nombreux champs multidisciplinaires incluant entre autres : \n\n\n 	les algorithmes et les structures de données pour les séquences\n 	la représentation et la visualisation des connaissances et les bases de données\n 	l’évolution\, la phylogénie et la génomique comparée\n 	la génomique fonctionnelle et intégrative\n 	la métagénomique\, la métatranscriptomique et les écosystèmes microbiens\n 	la bioinformatique structurale et la protéomique\n 	les statistiques\, l’apprentissage\, l’intelligence artificielle et l’analyse d’image\n 	la biologie des systèmes et la métabolomique\n 	les workflows\, la reproductibilité et la science ouverte
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SUMMARY:20 ans de Biogenouest
DESCRIPTION:En 2022 le GIS fête les 20 ans de sa création. \nSur invitation\, le 30 juin un temps fort rassemblera les acteurs\, partenaires et financeurs du réseau. \nVous souhaitez recevoir une invitation ? Adressez un mail à communication@biogenouest.org \nAvec le soutien de : \n \n                             
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SUMMARY:Journées scientifiques Cancéropôle Grand Ouest
DESCRIPTION:Ne passez pas à côté de l’opportunité d’échanger avec d’autres chercheurs\, cliniciens et étudiants en cancérologie du Grand Ouest.\nDate limite de d’inscription : 23 mai 2022
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SUMMARY:La microscopie électronique en sciences de la vie
DESCRIPTION:La microscopie électronique en sciences de la vie\, exploration de la molécule au tissu dans des domaines de la santé\, des biomatériaux\, des sciences de l’aliment.\nLa microscopie électronique est une technologie en fort développement au sein de la communauté scientifique du Grand Ouest. Cette journée aura pour objectif de rassembler les scientifiques\, les responsables de plate-forme et les futurs utilisateurs de cette technologie autour de présentations qui couvriront des applications en sciences de la vie dans les domaines de la santé\, des biomatériaux\, des sciences de l’aliment. \nL’évènement se tiendra en présentiel sur le site d’Oniris – Campus sciences de l’alimentation à Nantes \n\nProgramme \n\n \n8:30 | Accueil café\n \n8:50 | Introduction de la journée (Laurence DUBREIL\, Philippe MOREAU) \nSession 1 : Modérateurs : Angélina D’ORLANDO (BIBS) et Romain MALLET (SCIAM) \n9:00 | « Parois cellulaires : leur variabilité dans le grain et leur impact sur la qualité des blés » par Fabienne GUILLON\, UR 1268 BIA\, Nantes\n \n9:30 | « Acidose lactique et dysfonction mitochondriale dans les macrophages – l’apport de la microscopie électronique » par Yves DELNESTE\, UMR 1307 CRCI2NA\, Equipe 4\, Angers \n10:00 | « Observation au cryo-MEB de cellules dans un hydrogel fortement hydraté\, cryofixé en azote pâteux » par Sébastien GRASTILLEUR\, SC3M/UMR 1229 RMeS\, Nantes\n \n10:30 | Pause\n \nSession 2 : Modérateurs : Joëlle VEZIERS (SC3M) et Philippe MOREAU (IMN) \n11:00 | « Caractérisation de l’hétérogénéité structurale des microtubules par cryo-tomographie électronique » par Denis CHRETIEN\, MRic\, Rennes \n11:30 | « De la fibre macroscopique à la nanofibre: visualisation de la cellulose à différentes échelles par microscopie électronique » par Ana VILLARES\, UR 1268 BIA\, Nantes \n12:00 | « 3D MEB : serial block face Imaging par ultramicrotomie in situ » par Etienne GONTIER\, Bordeaux Imaging Center\, Bordeaux \n12:30 | Buffet\n \nSession 3 : Modérateurs : Laurence DUBREIL (APEX) et Bruno NOVALES (BIBS) \n13:30 |« Préparation d’échantillons cellulaires pour la microscopie électronique et l’imagerie chimique » par Benoit GALLET\, UMR 5075 Institut de Biologie Structurale\, Grenoble \n14:00 | « Elucidating the solid-liquid interface of (bio)materials using 3D-FIB/SEM and STEM/EELS at cryogenic temperatures » par Patricia ABELLAN\, UMR 6502 IMN\, Nantes \n14:30 | « Electron microscopy for studying V0-ATPase function in brush border maintenance and related absorption disorders: combined use of C. elegans and intestinal organoids » par Ophélie NICOLLE\, UMR 6061 IGDR\, Rennes \n15:00 | « Exemples d’applications du S/TEM Nant’Themis en sciences de la vie » par Eric GAUTRON\, UMR 6502 IMN\, Nantes \n15:30 | « Les vésicules extracellulaires : de l’observation tissulaire à la modélisation 3D après cryo-tomographie électronique » par Aurélien DUPONT\, MRic\, Rennes \n16:00 | « Méthodes d’analyse d’image pour la microscopie corrélative » par Perrine PAUL-GILLOTEAUX\, MicroPICell\, Nantes \n16:30 | Conclusion\n \n  \nL’évènement se tiendra en présentiel sur le site d’Oniris – Campus sciences de l’alimentation à Nantes \nProgramme
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LOCATION:Oniris – Campus Sciences de l’Alimentation\, Rue de la Géraudière\, Nantes\, 44322
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SUMMARY:Congrès AFH (Association Française d'Histotechnologie)
DESCRIPTION:Programme et inscription. \n  \n35ème Congrès – Marseille Invitation à l’Histologie en Provence.
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LOCATION:Marseille\, Marseille\, 13000\, France
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SUMMARY:Journée de l'axe Bio-informatique
DESCRIPTION:L’intelligence Artificielle au service des sciences de la vie\n \nPROGRAMME \nFormat hybride : Amphi TA Villejean (Pôle Numérique Rennes Villejean). \n12:00 〉 Déjeuner \n13:30 〉Tour des plates-formes de Bio-informatique de l’Ouest par Audrey BIHOUEE [BiRD\, Nantes]\, Olivier COLLIN [GenOuest\, Rennes]\, Gildas LE CORGUILLE [ABiMS\, Roscoff]\, Cyril NOËL [SeBiMER\, Brest]. \n14:00 〉Exposé introductif général par François COSTE  [équipe Dyliss\, Irisa\, Rennes]. \n14:30 〉Extraction d’informations écologiques à partir de gros volumes de données d’imagerie quantitative : questions\, défis et (début de) solution avec des réseaux de neurones convolutifs par Jean-Olivier IRISSON et Thelma PANAIOTIS [Laboratoire d’Océanographie de Villefranche]. \n15:00 〉Influence de l’expertise sur l’attention visuelle humaine et machine dans une tâche de classification d’images médicales par Rémi VALLEE et Harold MOUCHERE [LS2N\, Nantes]. \n15:30 〉Apprentissage informé par la physique & observation des océans par Ronan FABLET [Lab-STICC\, Brest]. \n16:00 〉Tests de comparaison d’échantillons pour les données single-cell RNA sequencing par Anthony OZIER-LAFONTAINE [Laboratoire de Mathématiques Jean Leray\, Nantes]. \n16:30 〉Nadim DAHER [Nvidia]. Titre à venir \n17:30 〉Conclusion. \nPROGRAMME
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SUMMARY:BIO-Europe Spring
DESCRIPTION:BIO-Europe Spring est un rassemblement de l’industrie biopharmaceutique.
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SUMMARY:Gen2Bio : Bio-informatique intégrative : avancées et défis
DESCRIPTION:24-25 mars 2022 à La Baule \nBio-informatique intégrative : avancées et défis #MachineLearning #DataSharing #OpenScience #Biology \nEn format hybride : présentiel et distanciel. \nProgramme et informations sur ces 2 journées ICI
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LOCATION:La Baule\, 119 Avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny\, La Baule\, 44503\, France
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SUMMARY:Journée de l'axe Protéomique
DESCRIPTION:Chaque année l’axe « Protéomique » de Biogenouest organise une journée d’animation scientifique. En 2022\, cette journée se déroulera en webinaire. Vous aurez l’opportunité d’y découvrir des présentations des plate-formes composant l’axe (CristalO\, Impact\, P2R\, Protim) et leurs nouveautés technologiques. Vous assisterez également à des présentations de projets de recherche associant les développements technologiques de nos plates-formes pour des applications dans les domaines de la mer\, de l’agronomie ou de la santé. \n \nLe potentiel des interactions en biologie from Biogenouest on Vimeo. \nINSCRIPTION \nProgramme : \n9:00 〉 Accueil \n9:30 〉Introduction\, présentation des plates-formes de l’axe Protéomique\, Karine Bernardeau\, plate-forme P2R et Thomas Roret\, plate-forme CristalO. \n9:45 〉Présentation de la plate-forme Protim : nouveaux développements pour la préparation des échantillons disponibles en faible quantité par Emmanuelle Com\, plate-forme Protim\, Rennes. \n10:15 〉La protéomique pour intercepter le dialogue embryo-maternel précoce par Marie Saint-Dizier\, UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements (PRC)\, Centre INRAE Val-de-Loire\, Nouzilly\, utilisatrice de la plate-forme Protim. \n10:45 〉Pause \n11:00 〉Présentation de la plate-forme IMPACT : un continuum d’offre pour le « Drug Screening » : intégration du criblage in silico par Mike Maillasson et Erwan Mortier\, Nantes. \n11:30 〉Conception d’inhibiteurs des systèmes IL-2/IL-15 par criblage virtuel et fragment-based drug design par Agnès Quemener\, CRCI2NA\, Nantes. \n12:00 〉Déjeuner (sur inscription uniquement). \n13:30 〉Présentation de la plate-forme P2R : nouveaux développements technologiques par Frédéric Pecorari\, plate-forme P2R\, Nantes. \n14:00 〉Production d’IL-34 agonistes et étude de leur potentiel en immunothérapie par Apolline Salama\, CRTI\, Nantes\, utilisatrice de la plate-forme P2R. \n14:30 〉Pause \n14:45 〉Présentation de la plate-forme CristalO : nouveaux développements technologiques et apport d’AlphaFold2 dans la caractérisation structurale par Thomas Roret\, Roscoff. \n15:15 〉Caractérisation d’une EPS dépolymerase d’un podovirus de Cobetia marina par Anne-Claire Baudoux\, UMR Adaptation et Diversité en Milieu Marin\, Roscoff\, utilisatrice de la plate-forme CristalO. \n15:45 〉Table ronde animée par Charles Pineau\, plate-forme Protim\, Rennes. \nINSCRIPTION
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SUMMARY:Journée d’animation scientifique - Axe Analyse Structurale et Métabolomique
DESCRIPTION:Comme tous les ans\, l’axe « Analyse structurale et Métabolomique » de Biogenouest organise une journée d’animation scientifique. Cette année\, en webinaire\, vous aurez l’opportunité d’y découvrir des présentations des Infrastructures nationales auxquelles les trois plate-formes de l’axe (BIBS\, Phenotic et Corsaire) sont rattachées. Vous assisterez également à des exposés (souvent proposés par de jeunes chercheurs de nos organisations) qui traiteront des technologies les plus récentes développées dans les différents dispositifs ainsi que des exemples d’applications aux différents domaines de la mer\, de l’agronomie et de la santé. \n\nProgramme \n9:00 | Introduction par Sophie Le Gall et Alain Bouchereau \nSession 1. Les Infrastructures nationales auxquelles sont connectées les 3 plates-formes de l’axe \n9:15 | Infrastructures Phenome et Emphasis par Tristan Boureau/Etienne Belin\, Phenotic\n9:45 | Infrastructure MetaboHUB par Alain Bouchereau\, Corsaire\n10:15 | Infrastructures Probe et CALIS par Sophie Le Gall\, BIBS\n10:45 | Pause \nSession 2. Quelles avancées technologiques et méthodologiques sur nos plates-formes ? \n11:00 | Aperçu de nouvelles méthodes analytiques basées sur la spectrométrie de masse à mobilité ionique cyclique : nouvelles perspectives pour la caractérisation structurale des oligosaccharides par Simon Ollivier\, BIBS\n11:30 | « Hyperpolarized NMR metabolomics » par Patrick Giraudeau\, Corsaire-Ceisam\n12:00 | « Active learrning appliqué aux données Phenobean » par Etienne Belin\, Phenotic\n12:30 | Pause repas \nSession 3. Vers quelles applications débouchent les technologies développées sur nos plates-formes ? \n13:30 | « A structural analysis of heated ovalbumin by crosslink proteomics to decipher egg-allergy modulation » par Mehdi Cherkaoui\, BIBS\n13:55 | « Évaluation de la diversité des structures et des interactions de la cellulose par RMN du solide » par Xavier Falourd\, BIBS\n14:20 | « La reconstruction de réseaux métaboliques à l’échelle du génome\, une modélisation au service de la détection de métabolites spécialisés. Illustration sur le modèle de champignon filamenteux Penicillium chrysogenum » par Delphine Nègre\, Corsaire-Thalassomics\n14:45 | « Isotopomics in breast cancer » par Charlotte Citérin\, Corsaire-Ceisam\n15:10 | « High throughput phenotyping related to seed and seedling traits of sugar beet genotypes (ANR AKER) » par Didier Demilly\, Phenotic-Geves\n15:35 |« Phénotypage de la croissance des parties aériennes de 16 génotypes d’Arabidopsis thaliana » par Antonin Bosc\, Titouan Grenier et Elie Lare\, Phenotic-IRHS\n16:15 | Conclusion \nProgramme \nINSCRIPTION
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SUMMARY:Les Folles Souris Nantaises #4
DESCRIPTION:Nous avons le plaisir de vous annoncer la tenue de la 4ème édition du colloque « Les Folles Souris Nantaises »\, qui aura lieu à dans le grand amphithéâtre de la faculté de Pharmacie (rue Biais)\, le 30 novembre prochain. \nLe programme est encore en cours de préparation\, mais vous aurez le plaisir d’entendre : \n\nChristelle Harly\, CRCINA : Contrôle transcriptionnel du développement des « Innate Lymphoid cells » chez la souris.\nRomain Capoulade\, Inserm UMR 1087\, Institut du Thorax : titre à venir.\nUlrich Jarry\, Biosit\, Rennes : Mise en place et valorisation d’un modèle orthotopique de cancer du poumon chez la souris.\nFabrice Pagniez\, EA 1155 : Modèles murins dans la stratégie de développement de nouveaux antifongiques.\nVincent Paillé\, Inserm U1280\, Phan : Impact d’une alimentation périnatale déséquilibrée sur le développement des préférences alimentaires et des circuits de la récompense chez le rat\nNathan Provin\, CRTI : Réduction du nombre d’animaux : génération d’un modèle d’organoïdes thymiques dans l’étude de la tolérance immune.\n\nL’inscription est gratuite mais obligatoire (places limitées) avant le 02 novembre 2021. Pour cela\, il suffit d’envoyer un mail à Valérie Pecqueret\, en précisant si vous participerez au buffet qui vous sera proposé (valerie.pecqueret@univ-nantes.fr). \nLe colloque des « Folles Souris Nantaises » a pour but de réunir une fois par an les scientifiques locaux utilisant le rongeur comme modèle animal pour promouvoir les contacts et aider à la diffusion des connaissances et des compétences sur ce modèle. Comme tous les ans\, une session éthique sur le thème « Pourquoi et comment utiliser le modèle rongeur pour mes travaux de recherche?\, Existe-t-il d’autres alternatives ? » est au programme. \nCe colloque s’adresse aux chercheurs statutaires\, post-doctorants\, aux doctorants\, et tout le personnel des services supports concernés. La participation à cette journée compte pour la formation continue en expérimentation animale. \nN’hésitez pas à diffuser l’annonce du colloque à vos contacts susceptibles d’être intéressés par cette journée. \nAu plaisir de vous retrouver lors de cette journée\, \nLes organisateurs \nSarah BECK-CORMIER\, Grégory BOUCHAUD\, Anne CAMUS\, Corinne HUCHET\, Marie LIABEUF\,  Valérie PECQUERET
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SUMMARY:Journée d'animation autour de la transparisation
DESCRIPTION:Inscription\nDans le cadre de l’axe bio-imagerie de Biogenouest\, les plateformes H2P2\, MRic\, APEX et MicroPICell vous proposent une journée d’animation autour de la transparisation des échantillons pour la microscopie. Les intervenants parleront de leur retour d’expérience sur les différentes méthodes de transparisation\, leur modalité d’acquisition ainsi que les résultats obtenus. Des temps d’échanges vous permettront de soumettre vos problématiques ou d’apporter vos propres solutions. \nProgramme : \n09:30 Introduction de la journée\nTransparisation et imagerie des échantillons sur MicroPICell\, par Marine Malloci\, Nantes.\nTransparisation\, immunomarquage et visualisation de cœur d’embryon et de valves cardiaques chez le Rat par Pascal Aumond\, Institut du Thorax\, Nantes.\nDiscussion \n10:15 Transparisation et imagerie des échantillons sur MRic par Xavier Pinson\, Rennes.\n« Transparisation des organes lymphoïdes secondaires chez l’humain » par Frédéric Mourcin\, MICMAC\, Rennes.\n« Essais de transparisation sur l’oeil de Xénope et sur des sphéroïdes issus de cellules épithéliales cristalliniennes » par David Reboutier\, IGDR\, Rennes.\nDiscussion \n11:00 Pause \n11:30 Transparisation et imagerie des échantillons sur APEX par Laurence Dubreil\, Nantes. \n« Transparisation de la tomate par Rapiclear et/ou CUBIC pour analyser la structure de la cuticule via les signaux de seconde harmonique générés par la cellulose cristalline » par Nathalie Geneix\, Équipe Ellipse\, BIA INRAE\, Nantes.« Multimarquage sur ganglion lymphatique de porc et transparisation par la méthode iDISCO » par Mireille Ledevin et Laurence Dubreil\, APEX PAnTher INRAE Oniris\, en collaboration avec Nicolas Bertho\, UMR BioEpar INRAE Oniris\, Nantes. \n12:20 Transparisation et imagerie des échantillons sur H2P2\, par Nicolas Mouchet Rennes.\n« Analyse d’image : services proposés par les plates-formes et outils adaptés aux échantillons épais » par Thierry Pécot et Magalie Feyeux\nDiscussion \n  \nInscription
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SUMMARY:JOURNÉE LIPIDOMYSTES 2021
DESCRIPTION:La plateforme des Lipidomystes a pour intérêt de mettre en commun les savoirs faire\, méthodes\, expériences et expertises dans le domaine de l’analyse de lipides en recensant les compétences en analyses de lipides en France.
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SUMMARY:Fronts de connaissances sur le microbiote des plantes
DESCRIPTION:Journée scientifique de l’axe Génomique.\n \nPROGRAMME \n13:00 Accueil \n13:15 « Le concept d’holobionte et la théorie de l’hologénome une révolution ? » par Philippe Vandenkoornhuyse\, UMR 6553 ECOBIO\, Rennes. \n13:45 « Implication des microARNs dans la communication plante-microbiote » par Harriet Middleton\, UMR 6553 ECOBIO\, Rennes. \n14:15 « Le microbiote des graines\, une composante négligée du phytobiome : nouvelles perspectives à travers une méta-analyse » par Marie Simonin\, UMR 1345 IRHS\, Rennes. \n14:45 « Meta-transcriptome de communautés microbiennes synthétiques pour l’identification de gènes d’intérêt » par Nathan Vannier\, UMR 6553 ECOBIO\, Rennes. \n15:15 Pause \n15:30 « Santé des plantes : décryptage d’une partie du dialogue complexe entre la plante\, le microbiote et un bioagresseur » par Stéphanie Daval\, UMR 1349 IGEPP\, Rennes. \n16:00 « Présentation de l’axe Génomique de Biogenouest » par Romain Causse-Vedrines – EcoGenO\, Stéphanie Bonnaud – GenoA\, et Gwenn Tanguy – Genomer. \n16:30 Discussion \nPROGRAMME
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SUMMARY:3e Conférence internationale MArine Fungal Natural Product MAFNAP
DESCRIPTION:         \n  \nLe 3ème MArine Fungal Natural Product MAFNAP aura lieu du 19 au 20 juillet 2021 EN LIGNE. \nUne occasion de découvrir les dernières avancées scientifiques dans le domaine des champignons marins et de suivre l’évolution du projet fédérateur de Biogenouest\, CatalyMar. \n  \nMots clés : Champignons marins\, Produits naturels\, Biotechnologie\, Génomique\, Biodiversité\, Bioprospection\, Métabolomique\, Découverte de médicaments. \n  \nfungi
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SUMMARY:PROTEOMIQUE - Journée scientifique : Approches pour la détection et la quantification d'interactions protéines/ligands
DESCRIPTION:Programme :\n\n8:50 | Accueil – Tests\n9:00 | Les plates-formes de l’axe Protéomique (équipe\, équipements\, technologies et activités) :\n– Thomas RORET – CristalO\, Roscoff \n– Pierre WEIGEL – IMPACT\, Nantes \n– Frédéric PECORARI – P2R\, Nantes \n– Emmanuelle COM – Protim\, Rennes \n09:45 | « High-throughput protein production » par Renaud VINCENTELLI\, Plateforme de production et d’interaction de protéines à haut débit\, AFMB\, Marseille\n10:30 | « Application of high-throughput quantitative interaction assays for the development of new peptide therapeutics » par Renaud VINCENTELLI\, Plateforme de production et d’interaction de protéines à haut débit\, AFMB\, Marseille\n11:15 | Pause\n11:30 | « The Growing Role of Structural Proteomics in Biology » par Sarah CIANFERANI-SANGLIER\, Spectrométrie de Masse BioOrganique (LSMBO)\, Strasbourg\n12:00 | « Interfaces between the human nucleosome and the retroviral integration complex as platform for host/pathogens interactions » par Vincent PARISSI\, Mobility of pathogenic genomes and chromatin dynamics (MoBile) Team\, Laboratoire de Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (MFP)\, Bordeaux\n12:30 | « Modélisation et interactomique » par Gilles LABESSE\, Centre de biologie structurale (CBS)\, Montpellier\n13:00 | Conclusion\n\n \n\n \nTélécharger la plaquette de l’offre intégrée de l’Axe protéomique de Biogenouest 
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SUMMARY:2ème Biennale internationale du CENN
DESCRIPTION:La deuxième Biennale internationale du CENN dédiée à la microscopie avancée se déroulera les 27 et 28 mai 2021. \nCet événement scientifique\, axé sur l’imagerie d’échantillons épais pour la biologie\, est organisé par le Centre d’Excellence Nikon Nantes (CENN)\, une collaboration unique en France entre la société Nikon\, la plate-forme MicroPICell (UMS3556 INSERM CNRS Université de Nantes) et la plate-forme APEX (UMR703 PAnTher INRAE Oniris). Il rassemblera des scientifiques de renommée mondiale\, experts en optique adaptative\, en nappe lumineuse et en techniques d’imagerie multiphotonique. \nL’inscription à la Biennale est gratuite mais obligatoire
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SUMMARY:Rencontre Immersion : Les applications de la microscopie
DESCRIPTION:Lors de la prochaine Rencontre Immersion le 13 avril\, venez découvrir comment la microscopie peut booster vos projets. \nProgramme – mardi 13 avril 10h-12h\nExpertises et services de 3 plates-formes de la communauté Campus mondial de la mer\n\nPIMM : Plate-forme d’imagerie et de mesures en microscopie du Service général des plates-formes technologiques de l’Université de Bretagne Occidentale\, par Philippe Eliès\nMERIMAGE\,  Station biologique de Roscoff – Analyses en microscopie optique et électronique dans les domaines mer et santé\, par Sophie Le Panse\nService de microscopie électronique à balayage de la Station marine de Concarneau – Apports de la microscopie électronique à effet de champ pour l’étude des micro-organismes\, par Cédric Hubas\n\nVisite virtuelle de la plate-forme PIMM\nPitchs scientifiques d’experts utilisant la plate-forme PIMM\n\nLa microscopie au service de l’étude de la pollution marine aux micro et nanoplastiques\, par Valentin Foulon (Université de Bretagne Occidentale\, LEMAR)\nLes abysses : la microscopie pour des études en profondeur\, par Lucile Durand (Ifremer\, LMEE)\nFabrication d’un capteur hyperfréquence pour la détection et le suivi de biofilms marins\, par Matthieu Longo (Lab-STICC)
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SUMMARY:Journées portes ouvertes plates-formes Biogenouest & SEA
DESCRIPTION:Plates-formes : ABiMS – CristalO – Genomer – KISSf – Merimage – Corsaire-Métabomer – SEAS \n\nMatinée : présentations (Zoom)\n\n9h00-9h15 > Introduction : Catherine BOYEN\n9h15-9h40 > ABiMS : E. CORRE\, M. HOEBEKE et G. LE CORGUILLE\n9h40-10h05 > Genomer : G. TANGUY et F. THOMAS\n10h05-10h30 > Métabomer : C. LEROUX\n10h45-11h00 > SEAS : C. CABRESIN\n11h00-11h25 > Merimage : S. LE PANSE et F. LE ROUX\n11h25-11h50 > KISSf : S. BACH et T. ROBERT\n11h50-12h15 > CristalO : T. RORET \n\nAprès-midi Visites\n\nChoix entre 3 créneaux : 14h00-14h40 | 15h00-15h40 | 16h00-16h40 \nPour des questions de conditions sanitaires\, il n’y aura que 6 personnes max par créneau. \nLien pour les visites plates-formes Biogenouest & SEAS le 9 Avril. \nLe 9 Avril auront lieu les visites des plates-formes et la journée commencera en matinée avec des présentations des plates-formes et du SEAS. \nRéunion Zoom de Teams LBI2M > Participer à la réunion Zoom.\nID de réunion : 829 9030 2234
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LOCATION:Roscoff\, Roscoff\, 29680\, France
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SUMMARY:Journée Biologie 3D BIOSIT
DESCRIPTION:BIOSIT organise une journée intitulée BIOLOGIE 3D dans le but de réunir les chercheurs et stimuler les échanges et collaborations dans les domaines d’organoïdes\, bio-impression\, imagerie\, culture tissulaire\, organes sur puces. \nINSCRIPTION \nProgramme \n9:00-16:40 \n\nAccueil visioconférence\nPrésentation de Biosit et de Biogenouest\nIn vitro 3D models for renal cancer research // Yannick Arlot\, IGDR\, Biosit\nCultures 3D de cellules épithéliales mammaires par agitation orbitale // Frédéric Percevault\, Irset\, équipe « Transcription\, environnement et cancer»\nGénération de modèles pré-cliniques de cancer du poumon à petites cellules // Rémy Pedeux\, COSS \, Inserm U1242\nLes billes d’alginate : un nouveau modèle 3D pour mimer la niche du lymphome folliculaire ? // Frédéric Mourcin\, MICMAC\, INSERM U1236\nPause\nExtrusion based bioprinting and its application for the creation of a complex multicellular liver model // Marie Cuvellier\, Irset\, équipe « Dynamique du Micro-Environnement et Cancer»\nInfluence(s) des hydrocarbures aromatiques polycycliques sur la communication intercellulaire: rôles des vésicules extracellulaires // Eric Le Ferrec\, Irset\, équipe « Stress Membrane et Signalisation »\nMicrosystems and NanoBioanalytical tools for characterization of cellular secretome // Céline Elie-Caille\, FEMTO-ST\, Besançon\nBio-impression et Microfluidique 3D : Proposition de Plate-forme // Laurent Griscom \, Responsable Technique Bio3D\, UMS Biosit\n12:20 Pause déjeuner\n13:30 Accueil\nLa microscopie pour l’observation du vivant en 3D et en profondeur // Xavier Pinson\, Plate-forme MRic\, Biosit\nReconstruction 3D d’une coupe d’organe transparisée // Nicolas Mouchet\, H2P2\, Biosit\nIntestinal rare diseases: from C. elegans to mouse organoids // Grégoire Michaux\, IGDR\nModelling early brain development to explore pathophysiology of midline disorders // Erwan Watrin\, IGDR\nNeurotoxicité du tramadol sur des organoïdes cérébraux // Pierre-Jean Ferron \, NuMeCan\nPause\nEtude de la physiopathologie du cristallin\, vers un nouveau model 3D ? // David Reboutier & Matthieu Duot\, IGDR\, équipe « Expression Génétique et Développement »\nApport de la microfluidique dans le maintien à long terme des fonctions du testicule murin ex vivo: success story chez la souris\, quid chez l’homme ? // Christele Desdoits\, Irset\, équipe « Physiologie et physiopathologie du tractus uro-génital »\nDéveloppement des organoïdes coliques humains pour étudier la réparation épithéliale dans la rectocolite hémorragique // Annaig Lan\, NuMeCan\n16:40 Conclusion\n\nINSCRIPTION
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SUMMARY:Journée Micro organisme/symbiose/microscopie sur des échantillons marins et des végétaux
DESCRIPTION:La journée d’animation du 19 mars 2021\, organisée par Biogenouest portera sur les thèmes « symbiose\, et microscopie chez les microorganismes et les végétaux marins » . Les associations vont du mutualisme au parasitisme et lient intimement deux partenaires sur du long terme pour le meilleur comme pour le pire. La microscopie permet de révéler et d’étudier ces interactions au plus près des organismes\, avec des techniques en pleine mutation. Cette journée leur est dédiée\, écologues du milieu terrestre plus que bienvenus ! \n \nProgramme  \n9:00 | TESTS \n9:10 | Présentation des plates-formes de Bio-imagerie de Biogenouest par Perrine PAUL-GILLOTEAUX\, plate-forme MicroPICell\, Nantes\n9:20 | Investigating the biodistribution of mCherry labelled Staphylococcus aureus in the porous wood material using confocal spectral laser microscopy par Muhammad TANVEER MUNIR\, Ecole supérieure du bois\, LIMBHA\, Nantes\n09:40 | Régulations immunitaires impliquées dans le contrôle des bactéries endosymbiotiques et l’homéostasie de l’hôte par Abdelaziz HEDDI\, UMR 0203 « Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions » (BF2I)\, Lyon\n10:10 | Pause\n10:30 | Apport de la microscopie photonique\, électronique\, tomo\, CLEM pour l’étude des mécanismes cellulaires impliqués lors du processus de greffage chez Arabidopsis par Lysiane BROCARD\, Bordeaux Imaging Center\, Bordeaux\n10:50 | Décryptage fonctionnel d’un virus mutualiste de guêpes parasitoïdes par Marc RAVALLEC & Anne Nathalie VOLKOFF\, UMR 1333 « Diversité\, Génomes & Interactions Microorganismes – Insectes » (DGIMI)\, Montpellier\n11:20 | Etude du parasitisme au sein du plancton marin par des techniques d’imagerie haute résolution par Johan DECELLE\, laboratoire physiologie cellulaire & végétale\, CEA-Grenoble / Laure GUILLOU\, UMR 7144 « Adaptation et Diversité en Milieu Marin »\, responsable scientifique de la plate-forme Merimage\, Roscoff\n11:50 | Conclusion \n  \nGregarine par Sophie Le Panse – Merimage  \nSophie Le Panse – Merimage  \nSophie Le Panse – Merimage  \nDiatomées par Sophie Le Panse – Merimage
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SUMMARY:Hackathon projet fédérateur MoDaL
DESCRIPTION:Chers et chères collègues\,  \nNous sommes ravis de vous annoncer que le hackathon MoDaL aura lieu les 25 janvier et 1er février 2021 ! \nLe Hackathon aura pour but le travail collaboratif\, le partage d’expériences\, de  connaissances sur  l’intégration de données hétérogènes en sciences de la vie et sur le développement des sciences ouvertes (principes FAIR).  \nLa capacité d’accueil est limitée\, inscrivez-vous dès que possible ! \nFormulaire d’inscription  \nNombre  maximum de participants : 40 \n\n[WEBINAIRE] \nL’inscription au hackathon est gratuite\, mais obligatoire.  \nDate limite d’inscription : 18 janvier 2021. \n\nNous vous préparons un beau programme avec des moments d’échanges entre participants pour préserver le caractère dynamique qui caractérise ce type d’événements ! \nLors de cet événement\, nous travaillerons ensemble sur vos mini-projets. Toutes les compétences sont les bienvenues\, en (bio)-informatique et dans les sciences de la vie et de la santé.  \nTous les projets seront présentés lors du premier jour du Hackathon et chaque participant pourra décider auxquels il veut participer  ! \nDifférents espaces seront mis en place : \n\nTables virtuelles – participation aux mini-projets.\nEspaces d’exposés flash\, où chacun d’entre vous pourra exposer brièvement (environ 5 min) un retour d’expérience en intégration de données\, un outil ou un sujet qui vous tient à cœur !\nEspace pédagogique\, facultatif\, sera prévu en parallèle au travail sur les mini-projets. Ces tutoriels dureront environ 30 min et cibleront un outil et/ou une méthode autour de l’intégration de données et des principes FAIR. \n\nPour toutes informations complémentaires : sofia.strubbia@univ-nantes.fr  \nSofia pour l’équipe MoDaL \n \n— \nhttps://biogenouest.github.io/biogen-hack-2020/  
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DESCRIPTION:Chers et chères collègues\,  \nNous sommes ravis de vous annoncer que le hackathon MoDaL aura lieu les 25 janvier et 1er février 2021 ! \nLe Hackathon aura pour but le travail collaboratif\, le partage d’expériences\, de  connaissances sur  l’intégration de données hétérogènes en sciences de la vie et sur le développement des sciences ouvertes (principes FAIR).  \nLa capacité d’accueil est limitée\, inscrivez-vous dès que possible ! \nFormulaire d’inscription  \nNombre  maximum de participants : 40 \n\n[WEBINAIRE] \nL’inscription au hackathon est gratuite\, mais obligatoire.  \nDate limite d’inscription : 18 janvier 2021. \n\nNous vous préparons un beau programme avec des moments d’échanges entre participants pour préserver le caractère dynamique qui caractérise ce type d’événements ! \nLors de cet événement\, nous travaillerons ensemble sur vos mini-projets. Toutes les compétences sont les bienvenues\, en (bio)-informatique et dans les sciences de la vie et de la santé.  \nTous les projets seront présentés lors du premier jour du Hackathon et chaque participant pourra décider auxquels il veut participer  ! \nDifférents espaces seront mis en place : \n\nTables virtuelles – participation aux mini-projets.\nEspaces d’exposés flash\, où chacun d’entre vous pourra exposer brièvement (environ 5 min) un retour d’expérience en intégration de données\, un outil ou un sujet qui vous tient à cœur !\nEspace pédagogique\, facultatif\, sera prévu en parallèle au travail sur les mini-projets. Ces tutoriels dureront environ 30 min et cibleront un outil et/ou une méthode autour de l’intégration de données et des principes FAIR. \n\nPour toutes informations complémentaires : sofia.strubbia@univ-nantes.fr  \nSofia pour l’équipe MoDaL \n \n— \nhttps://biogenouest.github.io/biogen-hack-2020/  
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SUMMARY:FAIR #bioanalyse : outils et environnements
DESCRIPTION:Journée de l’axe Bio-informatique de Biogenouest. \nProgramme Complet \n\n  \n9:30 | « Tour des plates-formes Bio-informatique de l’Ouest » par Audrey BIHOUEE [plate-forme BiRD\, Nantes]\, Olivier COLLIN [plate-forme GenOuest\, Rennes]\, Gildas LE CORGUILLE [plate-forme ABiMS\, Roscoff]\, Patrick DURAND [Sebimer\, Brest]\n10:00 | « FAIR & science reproductible » par Sarah COHEN-BOULAKIA\, Université Paris-Saclay\n10:30 | « Les outils de bioinfo : plus simples à installer et donc à réutiliser » par Gildas LE CORGUILLE\, plate-forme ABiMS\, Roscoff\n11:00 | « JupyterHub : interactive data science » par Julien SEILER\, IGBMC\, Strasbourg\n11:30 | « Go Bio with Containers » par Olivier SALLOU\, plate-forme GenOuest\, Rennes\n14:00 | « NextFlow : faire et reFAIR des analyses de données » par Cyril NOËL\, Sebimer\, Brest\n14:30 | « Les workflows snakemake\, il faut le FAIR » par Eric CHARPENTIER\, plate-forme BiRD\, Nantes\n15:00 | « Rejouer son article en un click » par Thomas DENECKER\, IFB Core\, Jouy-En-Josas
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CATEGORIES:Journée Scientifique
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SUMMARY:[Webinaire] Caractérisation de la micro-structure par RMN et IRM
DESCRIPTION:PRISM organise un webinaire le 3 Décembre 2020. Ce webinaire est centré sur le thème de la micro-structure via des mesures de RMN et d’IRM pour des applications en santé et sur les biomatériaux. \nProgramme à télécharger \n\n  \n9:00 | Café virtuel et accueil visioconférence (tests) \n09:15 | Présentation de la plate-forme de bio-imagerie PRISM par François MARIETTE\, plate-forme PRISM\, Rennes\n09:30 | Apports de l’IRM dans le développement de Biopolymères par Benjamin NOTTELET\, Institut of Biomolecules Max Mousseron\, Montpellier\n10:15 | Systèmes nanoparticulaires multimodaux et approches théranostiques en IRM par Bich-Thuy DOAN\, Chimie ParisTech PSL Research University\, Institute of Chemistry for Life and Health Sciences (i-CleHS)\, Paris\n11:00 | Compressed sensing MRI applied to food structure and milk filtration par Sebastian SCHUHMANN\, Institute of Mechanical Process Engineering and Mechanics\, Karlsruhe Institut für Teknologie\, Karlsruhe\n11:45 | « Vessel size imaging » et diffusion en IRM pour explorer la microarchitecture cérébrale par Emmanuel BARBIER\, Grenoble Institut des Neurosciences\, Grenoble \n12:30 | Conclusion \n  \n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n              \n\n\n\n\n\n\n\n      \n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n 
URL:https://www.biogenouest.org/evenements/webinaire-caracterisation-de-la-micro-structure-par-rmn-et-irm/
CATEGORIES:Journée Scientifique,Seminaire
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SUMMARY:Amnis® ImageStream® MkII Allier la puissance statistique de la cytométrie en flux à l’imagerie quantitative
DESCRIPTION:La plateforme de cytométrie et tri cellulaire Cytocell a décidé d’ouvrir l’accès à la technologie de cytométrie-imagerie Amnis ISX Mk II à de futurs utilisateurs autonomes. La PF se propose donc de former les utilisateurs à cette technologie et de les accompagner dans leurs projets. Par ailleurs\, le personnel de la PF continuera d’assurer des prestations de service en lien avec cette technologie. \nL’équipement de cytométrie-imagerie Amnis ISX Mk II permet de combiner la vitesse (5000 events par sec)\, la sensibilité et la capacité d’analyse phénotypique propre aux cytomètres en flux (12 canaux de fluorescence)\, avec l’imagerie détaillée et fonctionnelle spécifique à la microscopie \, en travaillant sur des échantillons cellulaires en suspension. \nAfin de vous présenter cette technologie\, la PF Cytocell vous convie à participer au webinaire suivant\, en partenariat avec la société Luminex : \n« Amnis® ImageStream® MkII\nAllier la puissance statistique de la cytométrie en flux à l’imagerie quantitative » \nPar Livine DUBAN\, ingénieur d’application Luminex \nMardi 24 novembre de 14h30 à 16h \n  \nL’accès au webinaire se fait sur inscription auprès de Nicolas Jouand \, responsable technique de la PF Cytocell : nicolas.jouand@univ-nantes.fr \nLe lien d’accès au webinaire vous sera envoyé après inscription\, quelques jours avant l’évènement. \nPour plus d’informations sur la technologie Amnis ISX Mk II\, contactez-nous directement et/ou consultez ce lien. \nVenez nombreux !
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CATEGORIES:Congrès,Journée Scientifique,Seminaire
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SUMMARY:Rencontres IMMERSION #Gen2BioJ+1
DESCRIPTION:La deuxième édition des Rencontres IMMERSION est organisée le lendemain de Gen2Bio pour permettre aux congressistes de prolonger leur séjour et découvrir d’autres expertises du territoire. Ces rencontres ont pour thème « la microscopie et ses multiples applications » et sont organisées en partenariat avec le service général des plates-formes technologique de l’Université de Bretagne Occidentale.
URL:https://www.biogenouest.org/evenements/immersion/
LOCATION:Brest\, 10 Av. Georges Clemenceau\, Brest\, 29200\, France
CATEGORIES:Journée Scientifique,Visite
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