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Bio-informatique ABiMS

Adresse(s)

Station biologique de Roscoff
Place Georges Teissier - CS 90074
29688 ROSCOFF Cedex

Contact(s)

Co-responsable IFB Grand Ouest

Gildas LE CORGUILLÉ

Tél. :

+33 (0)2 98 29 25 43

lecorguille [at] sb-roscoff [dot] fr

Responsable scientifique et technique

Erwan CORRE

corre [at] sb-roscoff [dot] fr

Voir le site web

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Prestations et offres techniques

ABiMS propose des analyses et des développements aux équipes de recherche dans le cadre de collaboration scientifique sous forme de projets. Son offre de service est répartie en cinq activités :
• e-infrastructure : cluster de calcul, Galaxy, JBrowse/Apollo, RStudio, banques, stockage and logiciels scientifiques
• Bio-analyse : analyse de données ‘-omics’ (RNAseq, assemblage, metagénomique, metabarcoding, etc.)
• Ingénierie logicielle : création de sites web, logiciels et de base de données
• Formation : RNASeq, phylogénie, Linux, R, Python
• Support : pour l’utilisation des ressources de calcul (logiciel, données, etc.)
• La plate-forme ABiMS appartient aux infrastructures nationales : Institut Français de Bioinformatique (IFB) et EMBRC-France.