10:00 - 10:45 Présentation des plates-formes de l’axe Protéomique (équipe, équipements, technologies et activités)
Protim (Emmanuelle Com)
IMPACT (Pierre Weigel)
P2R (Karine Bernardeau)
10:45 - 11:45 « The Human Protein Atlas - implications for human biology and precision medicine methods » par Cecilia Lindskog Bergström - Director Tissue Atlas, Human Protein Atlas; Head of Facility, Tissue Profiling Facility, SciLifelab - Uppsala University – Sweden
11:45 12:30 « Validating Missing Proteins in Human Sperm Cells by targeted mass-spectrometry- and antibody-based methods » par Charles Pineau, Plate-forme Protim
12:30 - 14:00 Buffet déjeunatoire
14:00 -14:45 « Dynamic study of protein interactions at the cell membrane level » par Mike Maillasson & Erwan Mortier, Plate-forme Impact
14:45 - 15:30 « Production of antibodies or F(ab)'2 with the ExpiCHO-S transient expression system» par Karine Bernardeau, Plate-forme P2R
15:30 - 16:15 « Etat de l’art en protéomique » débat animé par Charles Pineau
IMPLICATIONS FOR HUMAN BIOLOGY AND PRECISION MEDICINE
The spatial distribution of proteins determines the morphology and function of tissues, cells, and organelles. Knowledge of this spatial distribution is therefore essential to understand the healthy and diseased human body. The Human Protein Atlas project is an open source knowledge-based resource (www.proteinatlas.org) focusing on an integrated omics approach for in situ detection of human proteins down to the single cell level. All human protein coding genes have been classified using a combination of genomics, transcriptomics, proteomics and antibody-based profiling, and used for studying global protein expression patterns. A Tissue Atlas was launched in 2014 (Uhlen et al, Science, 2015), a Cell Atlas in 2016 (Thul et al, Science, 2017) and a Pathology Atlas in 2017 (Uhlen et al, Science, 2017). The Human Protein Atlas will continue to emerge in upcoming releases, with recent advances including expansion of the tissue repertoire in the quest for identifying the missing proteins, and in-depth analysis of cell-type specific expression patterns.
La répartition spatiale des protéines détermine la morphologie et la fonction des tissus, des cellules et des organites. La connaissance de cette répartition spatiale est donc essentielle pour comprendre le corps humain sain et malade. Le projet Human Protein Atlas est une ressource open source fondée sur le savoir (www.proteinatlas.org) axée sur une approche omique intégrée pour la détection in situ de protéines humaines jusqu'au niveau de cellule unique. Tous les gènes de codage de protéines humaines ont été classés en utilisant une combinaison de la génomique, de la transcriptomie, de la protéomique et du profilage à base d'anticorps et utilisés pour étudier les modèles globaux d'expression des protéines. Un Atlas de tissus a été lancé en 2014 (Uhlen et al, Science, 2015), un Atlas de cellules en 2016 (Thul et al, Science, 2017) et un Atlas de pathologie en 2017 (Uhlen et al, Science, 2017). L'Atlas des protéines humaines continuera à émerger dans les prochaines sorties, avec des progrès récents, y compris l'expansion du répertoire des tissus dans la recherche de l'identification des protéines manquantes, et une analyse approfondie des modèles d'expression spécifiques au type de cellule.
Dr. Lindskog is a group leader at Uppsala University, Uppsala, Sweden. Her research focuses on protein science, understanding the biology and functions of different organs, and the underlying mechanisms leading to cancer and other diseases. She has a PhD in pathology from the Faculty of Medicine, Uppsala University, and joined the Human Protein Atlas already in the early stage of the project, more than 10 years ago. Since 2014, Dr. Lindskog is director of the Tissue Atlas.
Her team creates a world unique atlas of spatial proteomics, showing the cell-type specific localization of all human proteins in a large set of normal and cancer tissues.
Dr. Lindskog is a group leader at Uppsala University, Uppsala, Sweden. Her research focuses on protein science, understanding the biology and functions of different organs, and the underlying mechanisms leading to cancer and other diseases. She has a PhD in pathology from the Faculty of Medicine, Uppsala University, and joined the Human Protein Atlas already in the early stage of the project, more than 10 years ago. Since 2014, Dr. Lindskog is director of the Tissue Atlas.
Her team creates a world unique atlas of spatial proteomics, showing the cell-type specific localization of all human proteins in a large set of normal and cancer tissues.
